arbetsgivarverket.se

Jobba Statligt

Postdoktor i komparativ genetik och genomik

  • Yrkesroll

    Genetiker

  • Anställning

    Heltid, 6 månader eller längre

  • Lön

    Fast månads- vecko- eller timlön

  • Publicerad

    13 september

  • Sök jobbet senast

    7 oktober

Om jobbet

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 44.000 studenter, 7.100 anställda och en omsättning på 7 miljarder kronor.

Professor Lindblad-Tohs forskning ligger inom en stark forskningsmiljö vid medicinska fakulteten på Uppsala universitet och SciLifeLab.

Gruppen har fokus på att använda komparativ genomik och genetik för att förstå komplexa sjukdomar, såsom cancer, immunologisk sjukdom och neuropsykiatriska sjukdomar. För att uppnå detta mål använder vi sekvenseringsdata från patienter och friska individer för att hitta sjukdomsassociationer i både hund och människa. Vi sekvenserar också många däggdjur för att förstå vilka bitar av människans arvsmassa som har en viktig funktion.

Just nu har vi ett antal stora dataset som behöver analyseras, t. ex. resekvenseringsdata för flera immunologiska sjukdomar i människa. Dessutom finns GWAS-data för cancer, atopi och renal dysplasia. Vi letar efter en innovativ, energisk och samarbetsvillig person, som kan jobba som del av ett team för att slutföra flera av dessa projekt.

Arbetsbeskrivning: Den som anställs kommer att arbeta med många olika tekniker inklusive GWAS i hundar och associationsanalys för flera immunologiska sjukdomar där både kodande och regulatoriska delar av 1,900 kandidatgener studeras. Associationsanalyser både med individuella SNPar och aggregerande associationsmetoder kommer att användas. Identifierade loci kommer att annoteras djupare med hjälp av ytterligare finmappning, expressionsdata och andra typer av funktionella genomikdata. Du kommer även att planera och utföra funktionella experiment inklusive EMSA och “luciferase assays” tillsammans med kollegor på labbet. Du kommer att kommunicera och ha regelbundna möten med gruppledare och kollegor samt med internationella samarbetspartners efter behov. Du väntas även presentera data på gruppmöten. Viss undervisning kan också ingå.

Kvalifikationskrav:


- Doktorsexamen i genomik, matematik, bioinformatik, computer science, statistik, genetik, eller relaterad disciplin. 

- Gedigen erfarenhet av datoranalys av genomik eller andra biologiska data, dokumenterad genom medförfattarskap på publicerade artiklar.

- Erfarenhet av programmering i flera språk inklusive R

- Förmåga att analysera och tolka data från storskalig sekvensering inklusive populationsbaserad WGS och WES, RNA-seq och ChiP-seq är önskvärd.

- Tidigare erfarenhet av data mining och integration är högst önskvärd, inklusive visualisering och tolkning av komplexa dataset.

- Erfarenhet av att använda high performance computing cluster och av att arbeta med human genomik data sets (inkl. Ensembl, NCBI, UCSC, HapMap, GEO, ArrayExpress, 1000 genomes) är positiv.

- Innovativt och kreativt tänkande

- Förmåga att arbeta både som del av ett team och individuellt, organisera arbetet effektivt och prioritera arbetsbördan.

- Förmåga att presentera data tydligt vid vetenskapliga möten

- Vilja att både ta och ge kritik på ett konstruktivt sätt.

- Utmärkt förmåga att tala och skriva på engelska.

Behörighetskrav: Behörig att anställas som postdoktor är den som har avlagt doktorsexamen eller motsvarande utländsk examen högst tre år före ansökningstidens utgång. Om det finns särskilda skäl kan doktorsexamen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer etc.

Uppsala universitet värdesätter de kvaliteter som jämn könsfördelning och mångfald tillför verksamheten. Vi ser därför gärna sökande av alla kön och med olika födelsebakgrund, funktionalitet och livserfarenhet.

Lön: Individuell lönesättning tillämpas.

Tillträde: Snarast för en period av två år.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning.

Anställningens omfattning: 100 %.

Upplysningar om anställningen lämnas av: Professor Kerstin Lindblad-Toh, kerstin.lindblad-toh@imbim.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 7 oktober 2019, UFV-PA 2019/2754.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.